Oddělení se zabývá průzkumem stavu historických fondů, analýzami, ambulantními opravami, konzervací a restaurováním poškozených objektů, výrobou ochranných obalů a zpracováním restaurátorských dokumentací.
Mezi hlavní činnosti oddělení patří konzervace a restaurování rukopisů a starých tisků, včetně plošných děl a dokumentů archivní povahy. Pro zmíněné objekty je zajišťována péče v rozsahu od preventivní konzervace až po ambulantní, částečné nebo komplexní restaurátorské zásahy. Těmto postupům předchází podrobný průzkum děl, kdy je zjišťována míra jejich mechanického poškození. V případě potřeby jsou vykonávány některé druhy analýz (měření pH papírové podložky, zjišťování mikrobiologické aktivity, atd.), často ve spolupráci s Oddělením vývoje a výzkumných laboratoří. Nedílnou součástí práce restaurátorů je podrobná písemná a obrazová dokumentace restaurovaných objektů, dokumentující jejich stav před zásahem, v jeho průběhu a po něm. Veškerá dokumentace je vkládána do Restaurátorského informačního systému (ResIS).
Oddělení se také zabývá výrobou různých typů ochranných obalů, od jednoduchých papírových obálek až po specifické krabicové systémy uzpůsobené individuálním potřebám některých exemplářů, jako jsou nadrozměrné svazky, atypicky deformované knihy nebo velkoformátová plošná díla.
Podstatnou oblastí práce oddělení je příprava objektů za účelem vystavení, s čímž je spojena tvorba Condition Reportů či výstavních stojánků. Restaurátoři také dohlíží na správný průběh transportu děl na místo konání výstavy, kde jsou následně instalována do vitrín. Podílí se také na kontrole vhodných klimatických a světelných podmínek ve výstavních prostorách instituce.